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免疫磁珠法(簡稱“磁珠法”)是一種簡單快速分離外泌體的方法，適合于外泌體的常覷分離和分析，基于針對外泌體膜表面的特征性蛋白設計的。外泌體表面有其特異性標記物(如CD63、CD9蛋白)，用包被抗標記物抗體的磁珠與外泌體囊泡孵育后結合，即可將外泌體吸附并分離出來。另外，西安干細胞公司該方法證明利用磁珠共沉淀下來的不只是外泌體，還有一些可溶性蛋白，提示我們再進行外泌體蛋白質組學的分析時需要考慮可溶性蛋白的干擾。磁珠法的優點是不依賴于超高速離心機，在普通實驗室即可完成；操作簡單，特異性高；可以用流式直接分析，能快速獲得外泌體不同亞型的分布情況，不影響外泌體形態完整等優點，但是效率低，外泌體生物活性易受pH和鹽濃度影響，不利于下游實驗。通常會利用超度離心或者密度梯度法分離得到總的外泌體，西安干細胞公司進一步用磁珠法分離表面標志物不同的外泌體亞型。具體操作步驟如下：
1.將條件培養基收集到50m離心管中,2000×g,4℃，離心10分鐘。
2.轉移上清到新的離心管中，重復上一步。
3.按照包被好抗體的磁珠的使用說明進行操作(例如：用含有3mg/ mI bsa的PBS洗5次，每次5ml)，利用磁鐵進行分離。
4.利用磁鐵對磁珠進行富集，并且去除上清，加入步驟2中所獲得的條件培養基并重懸磁珠。
5.將管子固定到旋轉搖床上室溫或者4℃孵育24小時，使外泌體膜上的蛋白和磁珠上對應的抗體充分結合。
6.用磁鐵富集磁珠，用2~10 mI PBs(含3mg/mBSA)洗磁珠，至少3次，以減少非特異性結合。
7.用不含BSA的PBS洗1次，以減少BSA的豐度。
8.用100μlPBS重懸磁珠，下游可進行FACS分析或者用密度梯度法進一步純化，西安干細胞公司也可直接用SDs樣品緩沖液處理后進行免疫印跡分析，或者固定后進行電鏡檢測。
